①氧化磷酸化：又称为电子传递水平磷酸化。在生物氧化过程中，代谢物脱下的氢经呼吸链氧化生成水的同时，所释放的能量驱动ADP磷酸化生成ATP，这种氧化与磷酸化相偶联的过程称为氧化磷酸化（oxidative phosphorylation），光解水发生在真核细胞的线粒体内膜或原核生物的细胞质中。

②底物水平磷酸化：代谢物在氧化分解过程中，有少数反应因脱氢或脱水而引起分子内部能量重新分布产生高能磷酸键，直接将代谢物分子中的高能磷酸键转移给ADP（或GDP）生成ATP（或GDP）的反应称为底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）。例如在糖的代谢过程中，甘油醛-3-磷酸脱氢并磷酸化生成甘油酸-1，3-二磷酸甘油酸，在分子中形成一个高能磷酸基团，在磷酸甘油酸激酶的催化下，甘油酸-1，3-二磷酸可将高能磷酸键基团转移给ADP，生成甘油酸-3-磷酸和ATP。